Bu bölüm, İslam’ın ana kaynaklarını; inanç, ibadet, hukuk, ahlak esaslarını ve alanı içerisindeki diğer konuları bu temel kaynaklara dayanarak akademik düzeyde ele almaktadır. Bunun için vazgeçilmez araç konumundaki kaynak dil ile İslam anlayışı çerçevesinde tarih içinde gün yüzüne çıkan dinî-mezhebî oluşumlar da bu bölümün ana konuları arasındadır. Buna göre Temel İslam Bilimleri Bölümü’nde şu anabilim dalları bulunmaktadır:
Arap Dili ve Belagatı Anabilim Dalı
Tefsir Anabilim Dalı
Kur'an-ı Kerim Okuma ve Kıraat İlmi Anabilim Dalı
Hadis Anabilim Dalı
Fıkıh Anabilim Dalı
Kelam ve İtikadi İslam Mezhepleri Tarihi Anabilim Dalı